L'avifaune abondante et variée de la Sierra de Guara a été déclarée comme zone de protection spéciale pour les oiseaux en 1998.

On trouve principalement des populations d'oiseaux rupicoles, de martinets alpins, de vautours percnoptères, de vautours fauves, de gypaètes barbus, d'aigles royaux, de pygargues à queue courte, de hiboux des marais, d'effraies des clochers, de craves à bec rouge et de milans royaux.

La Sierra de Guara est un point d’échange de nombreuses espèces de la chaîne pyrénéenne et constitue une enclave de la région biogéographique alpine et méditerranéenne. Grâce à cette localisation, la Sierra de Guara constitue la limite méridionale des plantes pyrénéennes et des communautés alpines et euro-sibériennes, où l'on trouve des hêtraies dans les ravins les plus humides et des sapins résiduels. Elle constitue aussi la limite d’échange de certains vertébrés pyrénéens endémiques comme le calotriton des Pyrénées.

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